Помимо вредных веществ, в сточных водах содержится бесчисленное множество бактерий и вирусов. Поэтому дезинфекция хлором широко используется для уничтожения бактерий и вирусов в воде на стадии сточных вод водопроводной воды и очистных сооружений.
При очистке промышленной оборотной охлаждающей воды хлор также используется для стерилизации и удаления водорослей. В процессе циркуляции охлаждающей воды из-за испарения части воды питательные вещества в воде концентрируются, а бактерии и другие микроорганизмы размножаются в больших количествах и легко образуют слизевую грязь. Слишком большое количество слизи приведет к засорению труб и коррозии.
Хлорирование обычно включает впрыскивание хлора в воду для уничтожения бактерий и других микроорганизмов, обычно в бутылочном хлоре.
Для поддержания бактерицидного эффекта остаточный хлор всегда должен поддерживаться на уровне {{0}},5 ~ 1мг/л в сбрасываемой воде и в конце водопроводной сети на уровне 0. 0,05 ~ 0,1 мг/л.